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對硝化污水處理系統的出水進行BOD5測定時，由于含有大量硝化細菌，因此測定結果包括氨氮等含氮物質的需氧量。當需要區分水樣中含碳物質的需氧量和含氮物質的需氧量時，可采用在稀釋水中加入硝化抑制劑的方法消除BOD5測量過程中的硝化作用，比如在每升稀釋水中加入10毫克2-氯-6-（三氯甲基）吡啶或10毫克丙烯硫脲等。
BOD5/CODCr接近1甚至大于1，這往往意味著檢測過程中存在誤差。檢測的每一個環節都必須復查，尤其是水樣采集是否均勻。但 BOD5/CODMn 接近 1 甚至大于 1 可能是正常的，因為高錳酸鉀對水樣中有機成分的氧化程度遠低于重鉻酸鉀。同一水樣的CODMn值有時會低于 CODCr 值許多。 當出現稀釋比越大、BOD5值越高的規律現象時，其原因通常是水樣中含有抑制微生物生長繁殖的物質。稀釋比低時，水樣中所含抑制物質的比例就越大，使細菌無法進行有效的生物降解，導致BOD5測定結果偏低。此時應查明抗菌物質的具體成分或成因，并進行有效的預處理，消除或掩蔽后再測定。 當 BOD5/CODCr 較低時，如低于 0.2 甚至低于 0.1，如果測量的是工業廢水，可能是因為水樣中有機物的生物降解性很差，但如果測量的水樣是市政污水或與一定比例的生活污水混合的工業廢水，除了水樣中存在化學有毒物質或抗生素外，更常見的原因是pH值非中性和存在余氯類殺菌劑等。為避免失誤，在BOD5測定過程中，必須將水樣和稀釋水的pH值分別調至7和7.2，并對可能含有余氯等氧化劑的水樣進行常規檢查.
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